Program Studi Agrobisnis Perikanan mengimplimentasikan Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI) yang ditetapkan oleh Universitas Pattimura dalam dokumen-dokumen sebagai berikut:
- Formulir SPMI Universitas Pattimura
- Kebijakan SPMI Universitas Pattimura
- Standar Mutu SPMI Universitas Pattimura
- Manual Mutu SPMI Universitas Pattimura
Bagan Alur Pelaksanaan Standar Mutu/SPMI:
Sasaran Mutu PS-AGP
- Minimal 80% lulusan memiliki IPK 3,20.
- Minimal 85% lulus tepat waktu sesuai kurikulum (4 tahun).
- Minimal masa tunggu kerja lulusan kurang dari 6 bulan setelah lulus.
- Mahasiswa terlibat dalam program kreativitas mahasiswa (PKM) sebanyak 1 judul per semester.